يهدف برنامج الباحث الإكلينيكي إلى إعداد الممارسين الصحيين ليصبحوا باحثين وقادة في الأبحاث السريرية والأساسية والترجمية. يركز البرنامج على تزويد المتدربين بالمعرفة والمهارات اللازمة لتصميم وتنفيذ وتحليل الدراسات البحثية وفقاً لأعلى المعايير العلمية والأخلاقية. يتضمن البرنامج دراسة مقررات أساسية في تصميم الدراسات والإحصاء الحيوي وكتابة المنح والنشر العلمي، بالإضافة إلى مشروع بحثي بإشراف مرشدين معتمدين من الهيئة. يساهم البرنامج في تحقيق مستهدفات رؤية 2030 من خلال بناء كوادر بحثية وطنية تسهم في تحسين جودة الرعاية الصحية ودعم الابتكار العلمي في المملكة.